Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
DUSP9Q99956 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms