Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COG8Q96MW5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms