Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VCPIP1Q96JH7 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VCPIP1Q96JH7 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms