Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms