Protein–RNA interactions for Protein: Q96AH0

NABP1, SOSS complex subunit B2, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NABP1Q96AH0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NABP1Q96AH0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms