Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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TRIM63Q969Q1 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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TRIM63Q969Q1 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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TRIM63Q969Q1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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TRIM63Q969Q1 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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TRIM63Q969Q1 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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TRIM63Q969Q1 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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TRIM63Q969Q1 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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TRIM63Q969Q1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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TRIM63Q969Q1 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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TRIM63Q969Q1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM63Q969Q1 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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