Protein–RNA interactions for Protein: Q969K7

TMEM54, Transmembrane protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM54Q969K7 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM54Q969K7 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms