Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKD1Q969G9 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKD1Q969G9 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKD1Q969G9 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKD1Q969G9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKD1Q969G9 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKD1Q969G9 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKD1Q969G9 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKD1Q969G9 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKD1Q969G9 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKD1Q969G9 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NKD1Q969G9 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD1Q969G9 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD1Q969G9 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD1Q969G9 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD1Q969G9 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD1Q969G9 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD1Q969G9 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD1Q969G9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD1Q969G9 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD1Q969G9 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD1Q969G9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD1Q969G9 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD1Q969G9 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD1Q969G9 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD1Q969G9 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD1Q969G9 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD1Q969G9 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD1Q969G9 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD1Q969G9 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD1Q969G9 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD1Q969G9 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD1Q969G9 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD1Q969G9 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD1Q969G9 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD1Q969G9 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD1Q969G9 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD1Q969G9 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD1Q969G9 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD1Q969G9 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD1Q969G9 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD1Q969G9 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD1Q969G9 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD1Q969G9 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD1Q969G9 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD1Q969G9 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD1Q969G9 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD1Q969G9 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD1Q969G9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD1Q969G9 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD1Q969G9 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
NKD1Q969G9 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
NKD1Q969G9 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD1Q969G9 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD1Q969G9 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD1Q969G9 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD1Q969G9 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD1Q969G9 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD1Q969G9 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD1Q969G9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD1Q969G9 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD1Q969G9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD1Q969G9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD1Q969G9 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD1Q969G9 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD1Q969G9 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD1Q969G9 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD1Q969G9 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD1Q969G9 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD1Q969G9 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD1Q969G9 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD1Q969G9 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD1Q969G9 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD1Q969G9 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD1Q969G9 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD1Q969G9 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD1Q969G9 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD1Q969G9 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD1Q969G9 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD1Q969G9 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD1Q969G9 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD1Q969G9 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD1Q969G9 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD1Q969G9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD1Q969G9 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD1Q969G9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD1Q969G9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD1Q969G9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD1Q969G9 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD1Q969G9 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD1Q969G9 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD1Q969G9 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD1Q969G9 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD1Q969G9 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD1Q969G9 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
NKD1Q969G9 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKD1Q969G9 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKD1Q969G9 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKD1Q969G9 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NKD1Q969G9 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms