Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SMARCE1Q969G3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms