Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FRAT1Q92837 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms