Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RABGGTAQ92696 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
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RABGGTAQ92696 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
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RABGGTAQ92696 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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RABGGTAQ92696 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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RABGGTAQ92696 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RABGGTAQ92696 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
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