Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX93

PALLD, Palladin, humanhuman

Predictions only

Length 1,383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALLDQ8WX93 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PALLDQ8WX93 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms