Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NEDD1Q8NHV4 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NEDD1Q8NHV4 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms