Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TMIEQ8NEW7 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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TMIEQ8NEW7 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TMIEQ8NEW7 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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