Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FSIP1Q8NA03 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FSIP1Q8NA03 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms