Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ZIC4Q8N9L1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms