Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6Q1

TMCO5A, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5AQ8N6Q1 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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TMCO5AQ8N6Q1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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TMCO5AQ8N6Q1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
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TMCO5AQ8N6Q1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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TMCO5AQ8N6Q1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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TMCO5AQ8N6Q1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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TMCO5AQ8N6Q1 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TMCO5AQ8N6Q1 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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