Protein–RNA interactions for Protein: Q8N448

LNX2, Ligand of Numb protein X 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX2Q8N448 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LNX2Q8N448 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LNX2Q8N448 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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