Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ96

CMTM1, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1Q8IZ96 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CMTM1Q8IZ96 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CMTM1Q8IZ96 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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