Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
KCNMB4Q86W47 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
KCNMB4Q86W47 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms