Protein–RNA interactions for Protein: Q86SZ2

TRAPPC6B, Trafficking protein particle complex subunit 6B, humanhuman

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6BQ86SZ2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TRAPPC6BQ86SZ2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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