Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZVN7

SEM1, Putative protein SEM1, isoform 2, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEM1Q6ZVN7 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEM1Q6ZVN7 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SEM1Q6ZVN7 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms