Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC171Q6TFL3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC171Q6TFL3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms