Protein–RNA interactions for Protein: Q6PI97

C11orf88, UPF0722 protein C11orf88, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf88Q6PI97 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C11orf88Q6PI97 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms