Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9G9

ZNF449, Zinc finger protein 449, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF449Q6P9G9 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF449Q6P9G9 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF449Q6P9G9 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF449Q6P9G9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF449Q6P9G9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF449Q6P9G9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF449Q6P9G9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF449Q6P9G9 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF449Q6P9G9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF449Q6P9G9 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF449Q6P9G9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF449Q6P9G9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF449Q6P9G9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF449Q6P9G9 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF449Q6P9G9 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF449Q6P9G9 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF449Q6P9G9 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF449Q6P9G9 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF449Q6P9G9 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF449Q6P9G9 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF449Q6P9G9 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF449Q6P9G9 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF449Q6P9G9 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF449Q6P9G9 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF449Q6P9G9 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZNF449Q6P9G9 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF449Q6P9G9 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF449Q6P9G9 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF449Q6P9G9 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF449Q6P9G9 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF449Q6P9G9 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF449Q6P9G9 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF449Q6P9G9 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF449Q6P9G9 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF449Q6P9G9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF449Q6P9G9 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF449Q6P9G9 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF449Q6P9G9 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF449Q6P9G9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF449Q6P9G9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF449Q6P9G9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF449Q6P9G9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF449Q6P9G9 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF449Q6P9G9 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF449Q6P9G9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ZNF449Q6P9G9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF449Q6P9G9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF449Q6P9G9 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF449Q6P9G9 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF449Q6P9G9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF449Q6P9G9 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF449Q6P9G9 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ZNF449Q6P9G9 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF449Q6P9G9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF449Q6P9G9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF449Q6P9G9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF449Q6P9G9 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF449Q6P9G9 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF449Q6P9G9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF449Q6P9G9 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF449Q6P9G9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF449Q6P9G9 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF449Q6P9G9 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF449Q6P9G9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF449Q6P9G9 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF449Q6P9G9 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF449Q6P9G9 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF449Q6P9G9 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF449Q6P9G9 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNF449Q6P9G9 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF449Q6P9G9 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF449Q6P9G9 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF449Q6P9G9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF449Q6P9G9 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF449Q6P9G9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF449Q6P9G9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF449Q6P9G9 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF449Q6P9G9 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF449Q6P9G9 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF449Q6P9G9 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF449Q6P9G9 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF449Q6P9G9 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF449Q6P9G9 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF449Q6P9G9 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF449Q6P9G9 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF449Q6P9G9 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF449Q6P9G9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF449Q6P9G9 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF449Q6P9G9 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF449Q6P9G9 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF449Q6P9G9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF449Q6P9G9 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF449Q6P9G9 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF449Q6P9G9 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF449Q6P9G9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF449Q6P9G9 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF449Q6P9G9 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF449Q6P9G9 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF449Q6P9G9 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNF449Q6P9G9 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms