Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6P435 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6P435 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6P435 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6P435 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6P435 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6P435 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6P435 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6P435 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6P435 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6P435 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6P435 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6P435 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6P435 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6P435 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6P435 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6P435 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q6P435 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6P435 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6P435 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6P435 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6P435 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6P435 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6P435 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6P435 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6P435 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6P435 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6P435 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6P435 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6P435 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6P435 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6P435 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6P435 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6P435 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6P435 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6P435 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6P435 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6P435 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6P435 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6P435 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6P435 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6P435 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6P435 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6P435 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6P435 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6P435 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6P435 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6P435 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6P435 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6P435 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6P435 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6P435 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6P435 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6P435 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6P435 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6P435 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6P435 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6P435 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6P435 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6P435 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6P435 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6P435 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6P435 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6P435 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6P435 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6P435 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q6P435 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6P435 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6P435 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6P435 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6P435 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6P435 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6P435 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6P435 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6P435 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6P435 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6P435 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6P435 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6P435 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6P435 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6P435 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6P435 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6P435 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6P435 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6P435 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6P435 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6P435 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6P435 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6P435 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6P435 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6P435 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6P435 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6P435 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6P435 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6P435 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6P435 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6P435 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Q6P435 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q6P435 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Q6P435 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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