Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
REEP3Q6NUK4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms