Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE6

LCN10, Epididymal-specific lipocalin-10, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN10Q6JVE6 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LCN10Q6JVE6 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms