Protein–RNA interactions for Protein: Q68D86

CCDC102B, Coiled-coil domain-containing protein 102B, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102BQ68D86 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC102BQ68D86 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms