Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USPL1Q5W0Q7 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms