Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C9orf135Q5VTT2 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms