Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PRAMEF20Q5VT98 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms