Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NHSL1Q5SYE7 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms