Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CEP78Q5JTW2 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CEP78Q5JTW2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms