Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CAVIN4Q5BKX8 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms