Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC9

EIPR1, EARP-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIPR1Q53HC9 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EIPR1Q53HC9 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms