Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
KLHL22Q53GT1 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KLHL22Q53GT1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms