Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms