Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GPAT3Q53EU6 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms