Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TTLL9Q3SXZ7 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms