Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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GEN1Q17RS7 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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GEN1Q17RS7 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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GEN1Q17RS7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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GEN1Q17RS7 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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GEN1Q17RS7 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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GEN1Q17RS7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GEN1Q17RS7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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