Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC142Q17RM4 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC142Q17RM4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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