Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RTL8BQ17RB0 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RTL8BQ17RB0 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms