Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TXNRD1Q16881 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms