Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTPRNQ16849 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRNQ16849 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms