Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PCK2Q16822 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms