Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ZIC1Q15915 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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ZIC1Q15915 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZIC1Q15915 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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