Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SKIV2LQ15477 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms