Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SF3A1Q15459 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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