Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
PTPRRQ15256 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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PTPRRQ15256 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPRRQ15256 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms